Kauno klinikose už mokslinius tyrimus ir studijų koordinavimą yra atsakinga Mokslo ir studijų koordinavimo tarnyba.
LSMU MA mokslo centrai Kauno klinikose:
- Kardiologijos institutas
- Endokrinologijos institutas
- Neuromokslų institutas
Universitetinėje ligoninėje pacientai gauna aukščiausios kokybės pagalbą, o medikai turi geriausias sąlygas suderinti mokslinį ir praktinį darbą. Kauno klinikose puoselėjamos ilgametės gydymo ir sveikatos priežiūros tradicijos kartu su moksliniais tyrimais bei diegiamomis inovacijomis, kurios suteikia didesnes galimybes ligoninės pacientams ir personalui. Čia dera klinikinė praktika, moksliniai tyrimai ir medicinos studijos. Kauno klinikų pagrindinis mokslinės veiklos tikslas – plėtoti integruotą mokslinę, klinikinę veiklą.
Universiteto ligoninėje vykdomos įvairaus spektro mokslinių tyrimų kryptys: gyvensenos ir aplinkos veiksnių įtakos sveikatai, sveikatos ekonomikos ir sveikatos sistemos bei klinikiniai moksliniai tyrimai.